MARS SMAK
Kami Putra-putri Kuncup Bunga Bangsa
Taruna Indonesia
Berjuang Bersama Raih Cita-cita Jadi
Insan Berguna
Tunaikan Kewajiban Dengan Hati Nan Riang,
Kalahkan Segala Macam Rintangan
Siswa-siswi SMAK,Santo Thomas Aquino Giat Belajar Tak Menyerah Serta Waspada Diri
Erat Bersaudara Tanpa Pandang Beda
Itulah Jiwa Kita
Mantapkan Pribadi Tingkatkan Prestasi
Juga Berolah Seni
Scientia Et Virtus,Scientia Et Virtus Itulah Semboyan Yang Abadi